Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT82Q9NSB4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms