Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBP3Q9NS15 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBP3Q9NS15 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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