Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLSPNQ9HAW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLSPNQ9HAW4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms