Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRDE2Q9H7Z3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRDE2Q9H7Z3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms