Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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