Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1EQ9GZS1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms