Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP74Q9C0B2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP74Q9C0B2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms