Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT23Q9C075 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms