Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRP1Q9C000 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP1Q9C000 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms