Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms