Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms