Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDHD3Q9BSH5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms