Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SEC22CQ9BRL7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC22CQ9BRL7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms