Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms