Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARXQ96QS3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARXQ96QS3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms