Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85AQ96PX6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms