Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNBD2Q96M20 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms