Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC136Q96JN2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC136Q96JN2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms