Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC34Q96HJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms