Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
STAMBPL1Q96FJ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms