Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNFT2Q96EX2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms