Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms