Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPS3Q969F9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPS3Q969F9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms