Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms