Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATAD2BQ8WXI9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms