Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms