Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BRK1Q8WUW1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms