Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC9Q8TBE3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms