Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM1Q8IZ96 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms