Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPAP2Q8IXW5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms