Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms