Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms