Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD163Q86VB7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms