Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLNKQ7Z7G1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms