Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L1Q7RTZ2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms