Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHST3Q7LGC8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST3Q7LGC8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms