Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BBS12Q6ZW61 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms