Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf139Q6ZV77 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf139Q6ZV77 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms