Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD6Q6ZV73 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms