Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms