Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC171Q6TFL3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC171Q6TFL3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms