Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3HQ6NTF7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms