Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCSAPQ6IQ19 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCSAPQ6IQ19 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms