Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REP15Q6BDI9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms