Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC102BQ68D86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms