Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREB3L3Q68CJ9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms