Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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