Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD4Q5VX71 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms