Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC93Q567U6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms