Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms